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近年来，学院获得国家技术发明二等奖、何梁何利基金科学与技术进步奖、江苏省科学技术进步一等奖等多项科学技术奖;获国家级科研项目146项，省部级科研项目45项，市厅级科研项目300余项;获发明专利125项;发表论文3000余篇，其中SCI收录论文1000余篇;学生在国家级重大赛事中取得突出成绩，获第十六届“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛特等奖，第五届中国“互联网+”大学生创新创业大赛银奖，获第十五届中国大学生年度人物，获第十二届中国青少年科技创新奖等荣誉。
学院毕业生素以基础扎实、实践能力强、勤奋实干又富有创新精神而著称，涌现出了一批以两院院士、长江学者、国家杰出青年科学基金获得者、享受国务院特殊津贴人员等为代表的杰出校友，为国家的医疗卫生事业做出了积极贡献，受到社会的充分肯定和广泛赞誉。
南通大学医学院有各自的团委、学生会和自管会(每个年级也有自己的团委和学生会)，也有校红十字会启秀分会、心协、科协、创协、广播站、社联、各社团。开学后，一般九月下旬到十月初会有招新。社团组织丰富想锻炼自己能力，展现自己不同方面才能的可以择优而取。
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